在使用標準海運冷藏集裝箱的時候如果是長距離運輸，那么箱內的溫度差不能超過3度，這樣才可以箱內的溫度保持在一個恒溫的狀態(tài)。如果是運輸新鮮的水果或者是蔬菜，那么要及時打開新風口，可以進行通氣。
冷藏集裝箱可用于多種交通運輸工具進行聯(lián)運
可以從產地到銷售點，實現(xiàn)“國到國”直達運輸，
一定條件下，可以當作活動式冷庫使用

機械式冷藏集裝箱也有一些缺點：如設備復雜、初始投資大、維修費用高；箱內溫度梯度要大于液氮冷藏集裝箱；箱內需設風機、風道系統(tǒng)，會增加箱內貨物的干耗、脫水。

使用中可以整箱吊裝，裝卸，運輸費用相對較低。
裝載容積利用率高，營運調度靈活，使用經濟性強。
新型冷藏集裝箱結構和技術性能更合理，有廣泛適用性。

①調溫范圍廣，從常溫到一20℃左右都能調節(jié)。通用性強，能運輸不同溫度要求的貨物；
②自動控制方便；
③箱內溫度分布較均勻：
④適宜遠距離運輸，這是其相對于其他形式冷藏集裝箱的的優(yōu)點。